More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1792 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1792  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.0332826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  77.03 
 
 
219 aa  339  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  77.03 
 
 
219 aa  339  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  74.19 
 
 
219 aa  336  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  76.44 
 
 
216 aa  327  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  70.75 
 
 
216 aa  314  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1067  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  71.36 
 
 
222 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.929448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.18 
 
 
222 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1768  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  54.63 
 
 
219 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.597766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.96 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.42 
 
 
218 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.43 
 
 
213 aa  201  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2521  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
216 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0652814  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3179  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.34 
 
 
217 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.5 
 
 
219 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48 
 
 
666 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3446  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
213 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
225 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.74 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.83 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
217 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
657 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.75 
 
 
213 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.8 
 
 
223 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1794  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.66 
 
 
217 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4410  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.15 
 
 
215 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.35 
 
 
220 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.77 
 
 
667 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.34 
 
 
208 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.37 
 
 
221 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09538  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.79 
 
 
213 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.67 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.56 
 
 
236 aa  165  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.94 
 
 
236 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.66 
 
 
217 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.27 
 
 
219 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.32 
 
 
208 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.32 
 
 
208 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.89 
 
 
221 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.32 
 
 
208 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.91 
 
 
394 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.5 
 
 
216 aa  164  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
213 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1682  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.33 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0422878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000768937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.91 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1734  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.27 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.91 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.45 
 
 
216 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.22 
 
 
208 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.84 
 
 
208 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.33 
 
 
208 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.88 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.37 
 
 
225 aa  160  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.22 
 
 
222 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0135  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.52 
 
 
206 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.38 
 
 
208 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.18 
 
 
211 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
225 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.88 
 
 
217 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1773  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.66 
 
 
217 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0590351  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.86 
 
 
208 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
208 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.85 
 
 
215 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.18 
 
 
660 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.9 
 
 
211 aa  158  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.83 
 
 
247 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  41.5 
 
 
244 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5883  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.29 
 
 
218 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.34 
 
 
220 aa  157  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.32 
 
 
197 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.22 
 
 
208 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.67 
 
 
223 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.15 
 
 
228 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.1 
 
 
211 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
211 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
218 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.93 
 
 
218 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1551  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.49 
 
 
218 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.31 
 
 
233 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>