More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2521 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2521  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0652814  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1794  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  73.49 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4410  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  71.03 
 
 
215 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3179  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  72.51 
 
 
217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1773  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  69.77 
 
 
217 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0590351  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  70.14 
 
 
217 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  70.62 
 
 
217 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
222 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.67 
 
 
219 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.66 
 
 
216 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1792  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
215 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.0332826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.75 
 
 
218 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.34 
 
 
216 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.01 
 
 
232 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.98 
 
 
208 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.74 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.21 
 
 
208 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 
225 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
219 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.6 
 
 
219 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.6 
 
 
219 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.21 
 
 
208 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.45 
 
 
660 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  48.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.64 
 
 
219 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1768  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.19 
 
 
219 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.597766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.08 
 
 
213 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.74 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.84 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.94 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.96 
 
 
233 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.18 
 
 
666 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2700  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  49.76 
 
 
230 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.9 
 
 
211 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
394 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.64 
 
 
211 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.64 
 
 
211 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.64 
 
 
211 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.64 
 
 
211 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
211 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
236 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
217 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
208 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
657 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.55 
 
 
211 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
218 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.26 
 
 
221 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1067  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.44 
 
 
222 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.929448  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2075  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.26 
 
 
212 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.85 
 
 
218 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.99 
 
 
223 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.46 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.95 
 
 
216 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
218 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.83 
 
 
226 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03724  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.18 
 
 
211 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.32477  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
221 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46 
 
 
220 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0186  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.79 
 
 
428 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000467688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.27 
 
 
211 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.27 
 
 
219 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.24 
 
 
211 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.88 
 
 
225 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  0.00000246992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.35 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.69 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.55 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.35 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.45 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.35 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.73 
 
 
217 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.67 
 
 
221 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.94 
 
 
306 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  normal  0.299077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
211 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
222 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
211 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  46.88 
 
 
211 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>