More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2790 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  100 
 
 
244 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.04 
 
 
236 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.96 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.11 
 
 
214 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.73 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.46 
 
 
236 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.17 
 
 
219 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  52.2 
 
 
216 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.32 
 
 
211 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.17 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.4 
 
 
217 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.2 
 
 
216 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.94 
 
 
215 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1546  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  53.2 
 
 
219 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2864  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.26 
 
 
247 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.444402  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.19 
 
 
220 aa  208  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.93 
 
 
221 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.7 
 
 
680 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.89 
 
 
215 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.94 
 
 
217 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.55 
 
 
245 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.26 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.61 
 
 
220 aa  198  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.42 
 
 
219 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.87 
 
 
219 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.5 
 
 
306 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  normal  0.299077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.53 
 
 
219 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.04 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0186  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.34 
 
 
428 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000467688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.8 
 
 
667 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.22 
 
 
218 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.49 
 
 
217 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.53 
 
 
657 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.72 
 
 
666 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
220 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.18 
 
 
206 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0314  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
210 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
217 aa  191  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
213 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
221 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.51 
 
 
215 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.04 
 
 
216 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1076  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.06 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.45 
 
 
208 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.29 
 
 
213 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0261  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.69 
 
 
225 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.95 
 
 
224 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.73 
 
 
219 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.57 
 
 
208 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.7 
 
 
208 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.7 
 
 
208 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.7 
 
 
208 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.83 
 
 
223 aa  184  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.57 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.07 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.745112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2892  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.94 
 
 
219 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.640231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4629  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.49 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0802433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4262  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.98 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.26 
 
 
394 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.94 
 
 
208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.72 
 
 
208 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
221 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.76 
 
 
223 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.88 
 
 
208 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
218 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.92 
 
 
219 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.91 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.81 
 
 
221 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.92 
 
 
211 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.47 
 
 
211 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.31 
 
 
660 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.88 
 
 
219 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.88 
 
 
219 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.15 
 
 
211 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.66 
 
 
211 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
211 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0380  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.98 
 
 
240 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
211 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
211 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.31 
 
 
222 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2075  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.31 
 
 
212 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.15 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.83 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3861  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.96 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>