More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4048 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  64.11 
 
 		 657 aa  866    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.82 
 
 		 667 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  55.18 
 
 		 684 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 		 660 aa  1349    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.19 
 
 		 680 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.09 
 
 		 665 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  66.97 
 
 		 666 aa  902    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  60.6 
 
 		 885 aa  535  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  60.6 
 
 		 885 aa  535  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  61.34 
 
 		 884 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  56.74 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  58.98 
 
 		 447 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  55.48 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  53.23 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  50.44 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  52.06 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  52.06 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  53.71 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  53.44 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  46.98 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  49.76 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  47.86 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  46.78 
 
 		 457 aa  350  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  49.52 
 
 		 452 aa  348  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  46.5 
 
 		 669 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  45.31 
 
 		 668 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  45.67 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  45.13 
 
 		 428 aa  327  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  45.13 
 
 		 428 aa  327  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  46.35 
 
 		 440 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  42.86 
 
 		 681 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  43.98 
 
 		 434 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  39.48 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  41.93 
 
 		 418 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  44.47 
 
 		 681 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  42.07 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  46.06 
 
 		 681 aa  294  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  44.52 
 
 		 679 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  44.52 
 
 		 679 aa  293  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  44.52 
 
 		 845 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  41.94 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  39.95 
 
 		 427 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.49 
 
 		 247 aa  283  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  37.73 
 
 		 443 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63.55 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  39.9 
 
 		 432 aa  260  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.43 
 
 		 219 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.6 
 
 		 219 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4285  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.56 
 
 		 217 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.49 
 
 		 225 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.22 
 
 		 219 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.09 
 
 		 245 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.05 
 
 		 214 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.87 
 
 		 220 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1354  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  53.74 
 
 		 245 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.25 
 
 		 223 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.77 
 
 		 217 aa  207  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4629  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.35 
 
 		 216 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0802433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4262  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.46 
 
 		 228 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.89 
 
 		 213 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.78 
 
 		 218 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.69 
 
 		 217 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.1 
 
 		 220 aa  197  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0380  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 		 240 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.12 
 
 		 216 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.2 
 
 		 217 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  36.23 
 
 		 401 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.3 
 
 		 215 aa  194  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.3 
 
 		 221 aa  193  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4917  fusion protein  54.4 
 
 		 205 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.12 
 
 		 216 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4779  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.48 
 
 		 212 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.09 
 
 		 218 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.05 
 
 		 232 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.06 
 
 		 219 aa  187  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.6 
 
 		 213 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.51 
 
 		 215 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.36 
 
 		 213 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.57 
 
 		 206 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.09 
 
 		 206 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.26 
 
 		 208 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.45 
 
 		 223 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.11 
 
 		 220 aa  183  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.34 
 
 		 217 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.76 
 
 		 208 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.31 
 
 		 222 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.76 
 
 		 208 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.76 
 
 		 208 aa  181  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 		 220 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.98 
 
 		 222 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.93 
 
 		 228 aa  180  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 		 208 aa  177  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.71 
 
 		 236 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.31 
 
 		 244 aa  177  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.76 
 
 		 208 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>