More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2684 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  98.06 
 
 
206 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  73.27 
 
 
217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  69.95 
 
 
216 aa  297  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  67 
 
 
216 aa  289  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  67 
 
 
217 aa  278  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  68.32 
 
 
215 aa  275  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.8 
 
 
214 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
217 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.95 
 
 
221 aa  225  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.23 
 
 
228 aa  202  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56 
 
 
219 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
223 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
223 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
213 aa  198  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.02 
 
 
208 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.22 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.98 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  54.04 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.02 
 
 
220 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
222 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
208 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
211 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.22 
 
 
208 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.96 
 
 
225 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.5 
 
 
215 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.26 
 
 
221 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
226 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.22 
 
 
208 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.27 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1928  L-isoaspartyl protein carboxyl methyltransferase (protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)  48.28 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.731042  normal  0.421823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.26 
 
 
216 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
666 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.63 
 
 
211 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 
225 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0335  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.22 
 
 
234 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
211 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
211 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
211 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.22 
 
 
219 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.55 
 
 
667 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.14 
 
 
236 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.72 
 
 
211 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51 
 
 
680 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
224 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1993  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.73 
 
 
210 aa  185  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
216 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.08 
 
 
236 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.97 
 
 
211 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.26 
 
 
211 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
208 aa  185  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  49.48 
 
 
211 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 
221 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
211 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.57 
 
 
660 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.26 
 
 
220 aa  184  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1563  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.74 
 
 
211 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1919  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.22 
 
 
225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.837211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1076  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.25 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.49 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2609  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.76 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3016  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.5 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.89 
 
 
211 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.08 
 
 
221 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
225 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
208 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
217 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.79 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48 
 
 
657 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.02 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.94 
 
 
245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.48 
 
 
208 aa  181  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.47 
 
 
211 aa  181  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.97 
 
 
211 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>