More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1313 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  77.44 
 
 
215 aa  323  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  73.85 
 
 
213 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63.08 
 
 
223 aa  267  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  62.94 
 
 
220 aa  255  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  65.64 
 
 
213 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.92 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.79 
 
 
216 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.28 
 
 
220 aa  201  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.9 
 
 
221 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  53.03 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.04 
 
 
225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.12 
 
 
236 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.78 
 
 
223 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
217 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.52 
 
 
215 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.79 
 
 
206 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.27 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.04 
 
 
657 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.41 
 
 
233 aa  187  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.78 
 
 
219 aa  187  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.06 
 
 
219 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.77 
 
 
215 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.88 
 
 
221 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.02 
 
 
217 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.04 
 
 
219 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.06 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
219 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.06 
 
 
217 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.55 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.36 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.53 
 
 
680 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
667 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
218 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.79 
 
 
232 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1546  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.15 
 
 
219 aa  175  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.79 
 
 
228 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.12 
 
 
220 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1894  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
203 aa  175  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
666 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2609  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.74 
 
 
220 aa  174  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
211 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1928  L-isoaspartyl protein carboxyl methyltransferase (protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)  43.59 
 
 
221 aa  174  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.731042  normal  0.421823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.44 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  49.21 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0339  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.72 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.104411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1551  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
224 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3446  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.89 
 
 
213 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1459  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.74 
 
 
225 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09538  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
213 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0147  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.68 
 
 
227 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
236 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.21 
 
 
660 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1993  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.62 
 
 
210 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
210 aa  169  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0361  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.23 
 
 
220 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.055477  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
213 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
225 aa  168  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0525  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.6 
 
 
206 aa  168  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.53 
 
 
208 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1919  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.09 
 
 
225 aa  167  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.837211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1049  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.74 
 
 
314 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.42 
 
 
208 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1141  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.24 
 
 
314 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5883  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.37 
 
 
218 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0261  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.21 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000651087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.47 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
208 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1317  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
216 aa  165  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
208 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
208 aa  165  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.42 
 
 
208 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0314  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0496  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.52 
 
 
211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.98 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
231 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
224 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2864  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.95 
 
 
247 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.444402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.17 
 
 
224 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1205  hypothetical protein  47.57 
 
 
321 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1734  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.63 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.62 
 
 
394 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>