More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1912 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1912  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  56.07 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3556  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2550  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3602  phosphate uptake regulator, PhoU  48.39 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2739  phosphate uptake regulator PhoU  47.95 
 
 		 221 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0103361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3367  phosphate uptake regulator, PhoU  49.02 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  36.95 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.81 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  30.99 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  31.39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  31.28 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  31.66 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0031  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.320331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  29.81 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.71 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  31.12 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  31.66 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  31.12 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  29.68 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  25.94 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  26.54 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  28.38 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1632  phosphate uptake regulator, PhoU  25.79 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  27.83 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  28.71 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  29.33 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  28.71 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  28.71 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  26.07 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  29.33 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  29.52 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.55 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  27.88 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  25 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  28.29 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  29.85 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.34 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1962  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  28.44 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  27.75 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>