180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1729 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  100 
 
 
370 aa  741    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  63.46 
 
 
373 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  59.19 
 
 
377 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  60.72 
 
 
377 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  59.32 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  59.32 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0197  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  53.03 
 
 
396 aa  328  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960003  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
370 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.73 
 
 
391 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  47.31 
 
 
365 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  42.25 
 
 
381 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  42.54 
 
 
384 aa  289  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  42.54 
 
 
381 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  41.97 
 
 
382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  41.97 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  41.97 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  42.25 
 
 
381 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
888 aa  288  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  42.25 
 
 
384 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  41.97 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  42.82 
 
 
374 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  44.72 
 
 
885 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0254  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.19 
 
 
754 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
902 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
892 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
889 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
912 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  41.69 
 
 
381 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  42.55 
 
 
658 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
890 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
895 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
897 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
900 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  41 
 
 
374 aa  275  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  42.9 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  44.76 
 
 
902 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.44 
 
 
902 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  41.48 
 
 
910 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
961 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  41.64 
 
 
894 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
836 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
836 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
896 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
901 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  41.64 
 
 
895 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  41.64 
 
 
894 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  41.64 
 
 
894 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  41.94 
 
 
860 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  41.64 
 
 
894 aa  269  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
836 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  40.17 
 
 
373 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1482  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.9 
 
 
731 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  41.86 
 
 
894 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  40.78 
 
 
371 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  41.57 
 
 
894 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1884  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
913 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0390049  normal  0.40253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2229  sensor histidine kinase KdpD  42.59 
 
 
913 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  41.57 
 
 
905 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  41.57 
 
 
894 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  41.57 
 
 
894 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
858 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  41.5 
 
 
374 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
894 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
894 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  41.35 
 
 
895 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  41.35 
 
 
894 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
907 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
850 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.05 
 
 
374 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
902 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.68 
 
 
553 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  39.61 
 
 
376 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.33 
 
 
853 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
894 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
887 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
897 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
887 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  40.22 
 
 
900 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.86 
 
 
832 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.65 
 
 
891 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
905 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
894 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  39.62 
 
 
915 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
947 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
947 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
907 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  40.86 
 
 
895 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
947 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
895 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
944 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
902 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  41.74 
 
 
937 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  42.06 
 
 
1035 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.94 
 
 
857 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
902 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  39.78 
 
 
895 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
949 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  39.56 
 
 
908 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  39.56 
 
 
908 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>