180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2617 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  100 
 
 
388 aa  782    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  63.4 
 
 
553 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  48.5 
 
 
379 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2574  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.58 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  42.77 
 
 
374 aa  302  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  44.02 
 
 
371 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  42.78 
 
 
374 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  43.66 
 
 
374 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1154  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.86 
 
 
375 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0108473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.77 
 
 
374 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  43.32 
 
 
370 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
900 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
888 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  43.8 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
905 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  44.29 
 
 
895 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  44.29 
 
 
894 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  43.7 
 
 
658 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  44.29 
 
 
894 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
894 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  44.01 
 
 
894 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  44.29 
 
 
895 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.77 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  44.01 
 
 
894 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  44.01 
 
 
894 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
901 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
907 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  44.01 
 
 
894 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  43.73 
 
 
894 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  43.73 
 
 
894 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  43.73 
 
 
905 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  43.73 
 
 
894 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  43.73 
 
 
894 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
912 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2088  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  43.16 
 
 
384 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.510085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  48.82 
 
 
905 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 
902 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
890 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  44.84 
 
 
885 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  46.13 
 
 
908 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 
905 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  46.13 
 
 
908 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  46.13 
 
 
908 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
907 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45 
 
 
892 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  43.78 
 
 
910 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  44.35 
 
 
1035 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  43.18 
 
 
895 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
902 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
889 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
897 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 
902 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  43.94 
 
 
910 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  43.82 
 
 
993 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  43.82 
 
 
993 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  43.82 
 
 
993 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
902 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
900 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0358  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
932 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  43.08 
 
 
377 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
899 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
887 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  42.29 
 
 
860 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
887 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.19 
 
 
377 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
895 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.12 
 
 
902 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
894 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  39.32 
 
 
384 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
836 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  43.35 
 
 
909 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  44.81 
 
 
937 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  39.03 
 
 
381 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  38.75 
 
 
381 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
897 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  46.01 
 
 
915 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  44.55 
 
 
905 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  38.75 
 
 
384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  39.03 
 
 
381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
836 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
836 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  39.32 
 
 
381 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  38.75 
 
 
384 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  40.84 
 
 
902 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
896 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  42.9 
 
 
370 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  38.46 
 
 
384 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
897 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  38.46 
 
 
382 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  38.46 
 
 
384 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.55 
 
 
391 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.8 
 
 
895 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 
949 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2229  sensor histidine kinase KdpD  41.78 
 
 
913 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.16 
 
 
891 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1884  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
913 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0390049  normal  0.40253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  41.83 
 
 
906 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  41.28 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  39.03 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
894 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>