More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1746 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  100 
 
 
553 aa  1132    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  63.4 
 
 
388 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  47.24 
 
 
374 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.9 
 
 
376 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  46.67 
 
 
374 aa  316  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  46.22 
 
 
374 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1154  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.52 
 
 
375 aa  313  6.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0108473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  45.21 
 
 
379 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  43.9 
 
 
371 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2574  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.55 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  44.21 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
900 aa  299  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  44.6 
 
 
894 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  44.6 
 
 
895 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  44.6 
 
 
894 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  44.6 
 
 
895 aa  296  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
894 aa  296  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  44.32 
 
 
894 aa  296  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  44.32 
 
 
894 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  44.32 
 
 
894 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  42.51 
 
 
910 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  45.14 
 
 
905 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  44.04 
 
 
894 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
912 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  40.29 
 
 
895 aa  290  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  44.86 
 
 
894 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  44.86 
 
 
894 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  44.86 
 
 
894 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  44.57 
 
 
894 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  40.89 
 
 
658 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
890 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  45.81 
 
 
860 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  43.77 
 
 
908 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  43.77 
 
 
908 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  43.5 
 
 
908 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  43.01 
 
 
910 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
902 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
836 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
836 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
836 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
858 aa  283  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  41.71 
 
 
370 aa  283  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
902 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.77 
 
 
902 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
850 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  42.89 
 
 
909 aa  279  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.04 
 
 
895 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0358  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
932 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
901 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
897 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
905 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  44.8 
 
 
373 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
897 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  41.75 
 
 
885 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
897 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  44.73 
 
 
915 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
900 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  42.86 
 
 
905 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
894 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  40.27 
 
 
887 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
907 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  40.64 
 
 
381 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  41.29 
 
 
381 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40 
 
 
887 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  42.12 
 
 
902 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.58 
 
 
891 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  41.18 
 
 
381 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
888 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
902 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
907 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
887 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
887 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
884 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  41.55 
 
 
381 aa  270  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  40.48 
 
 
384 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  40.48 
 
 
384 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  40.21 
 
 
384 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  40.48 
 
 
384 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  41.83 
 
 
906 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
896 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  42.78 
 
 
905 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38 
 
 
951 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  40.11 
 
 
382 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  40.11 
 
 
384 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  45.17 
 
 
1035 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  40.21 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
895 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  44.89 
 
 
993 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
897 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
905 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
892 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  44.89 
 
 
993 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
889 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  44.89 
 
 
993 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  44.32 
 
 
897 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
949 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
894 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
907 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.2 
 
 
854 aa  262  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
947 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>