181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1986 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  100 
 
 
374 aa  756    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  77.03 
 
 
371 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  72.46 
 
 
374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  69.79 
 
 
374 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  67.91 
 
 
374 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  69.15 
 
 
376 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1154  Osmosensitive K channel His kinase sensor  56.8 
 
 
375 aa  450  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0108473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  46.67 
 
 
553 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  44.57 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  42.77 
 
 
388 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2574  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.6 
 
 
375 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  40.77 
 
 
910 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  43.63 
 
 
373 aa  292  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.72 
 
 
377 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
890 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
899 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  43.25 
 
 
905 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
894 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  40.44 
 
 
658 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  37.57 
 
 
895 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  37.57 
 
 
894 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
894 aa  275  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
894 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
895 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  37.84 
 
 
894 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
894 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
894 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  37.57 
 
 
905 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
892 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  37.3 
 
 
894 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  37.3 
 
 
894 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  37.3 
 
 
894 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
907 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  42.82 
 
 
370 aa  272  8.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
887 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
887 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0358  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
932 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  37.3 
 
 
894 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
902 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  39.07 
 
 
910 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  40.55 
 
 
370 aa  269  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
900 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  38.67 
 
 
887 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
895 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.66 
 
 
902 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
888 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
897 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  38.86 
 
 
895 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.2 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.2 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
887 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  42.7 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.5 
 
 
895 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
902 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  39.17 
 
 
908 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  39.17 
 
 
908 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  39.17 
 
 
908 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  37.02 
 
 
885 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
947 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  37.04 
 
 
906 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  39.62 
 
 
384 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  42.42 
 
 
993 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  42.42 
 
 
993 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  42.42 
 
 
993 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2088  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  36.2 
 
 
384 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.510085  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  39.89 
 
 
902 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
897 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
947 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
947 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
947 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  39.08 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
949 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  42.12 
 
 
1035 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
897 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  39.62 
 
 
384 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  39.08 
 
 
384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40 
 
 
944 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  39.62 
 
 
384 aa  258  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  39.57 
 
 
382 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  39.67 
 
 
381 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  39.57 
 
 
384 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  39.4 
 
 
937 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
889 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  39.13 
 
 
381 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  39.67 
 
 
381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.89 
 
 
391 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  35.89 
 
 
885 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
912 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0720  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.69 
 
 
643 aa  255  9e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0117692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  35.62 
 
 
885 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
961 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0254  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.46 
 
 
754 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
901 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
907 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
894 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
902 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
907 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  38.16 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  40 
 
 
909 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  38.46 
 
 
915 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>