More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1857 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1857  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  62.56 
 
 
199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  45.26 
 
 
196 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  52.66 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  43.89 
 
 
191 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  43.89 
 
 
199 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1864  hypothetical protein  46.28 
 
 
195 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  41.57 
 
 
193 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  40.64 
 
 
193 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  39.89 
 
 
193 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  37.37 
 
 
193 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  43.58 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  43.58 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  43.93 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0995  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.71 
 
 
195 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0291721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  40.11 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  38.2 
 
 
192 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0225  SUA5/yciO/yrdC domain protein  40 
 
 
200 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  34.04 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.84 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.19 
 
 
348 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  34.93 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  33.84 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.3 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3964  SUA5/yciO/yrdC domain protein  33.78 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3785  SUA5/yciO/yrdC domain protein  34.46 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000349894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.2 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  33.68 
 
 
322 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  33.68 
 
 
322 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  32.24 
 
 
314 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.77 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  35.12 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.03 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.71 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.43 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  28.72 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  35.51 
 
 
337 aa  68.2  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.66 
 
 
331 aa  67.8  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.64 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.42 
 
 
344 aa  67  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.89 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00200  RNA binding yrdC protein  29.66 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0077597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0029  SUA5/yciO/yrdC-like protein  31.35 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00284591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  31.05 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.55 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.59 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.1 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0070  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.57 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0492893  hitchhiker  0.00000766437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  34.91 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.82 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.06 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.69 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0086  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  26.57 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  30.48 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  38.13 
 
 
312 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0029  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.32 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.864856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  31.38 
 
 
335 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  31.91 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.51 
 
 
347 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.77 
 
 
338 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0758  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.61 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.225685  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3060  translation factor SUA5  38.97 
 
 
323 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.5 
 
 
329 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.42 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0036  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0046  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  30.57 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0032  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.13 
 
 
337 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0036  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000077729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.69 
 
 
335 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.69 
 
 
329 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  34.81 
 
 
350 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1897  putative translation factor  32.76 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  37.75 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0086  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  26.57 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835524  hitchhiker  0.0000000000000733254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00384  translation factor  31.08 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0029  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  30.1 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.480067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.42 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0320  putative ribosome maturation factor  32.43 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00340055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0621  putative ribosome maturation factor  32.43 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000135377  normal  0.0218454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3878  putative ribosome maturation factor  32.43 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000521724  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0435  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.31 
 
 
316 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.79 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  31.28 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.33 
 
 
317 aa  62  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0089  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  25.87 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  hitchhiker  0.00000510467 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
341 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
341 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
341 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0417  hypothetical protein  30.72 
 
 
198 aa  62  0.000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
341 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.48 
 
 
337 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.91 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.41 
 
 
312 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
341 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
342 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0020  SUA5/yciO/yrdC-like  27.27 
 
 
185 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000304623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>