More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0758 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0758  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  100 
 
 
208 aa  406  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.225685  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.1 
 
 
338 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  36.08 
 
 
350 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.16 
 
 
204 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  41.54 
 
 
314 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.81 
 
 
202 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  43.65 
 
 
321 aa  101  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.72 
 
 
317 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.87 
 
 
203 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  35.47 
 
 
351 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.61 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.61 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  41.5 
 
 
335 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  39.9 
 
 
328 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.33 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  43.5 
 
 
333 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.9 
 
 
328 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.56 
 
 
348 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.04 
 
 
330 aa  97.8  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.11 
 
 
354 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.62 
 
 
326 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.2 
 
 
335 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  34.62 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.89 
 
 
359 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  40.51 
 
 
322 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.68 
 
 
335 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.88 
 
 
343 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
331 aa  95.1  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.43 
 
 
312 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1132  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.62 
 
 
329 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.71 
 
 
327 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.04 
 
 
360 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.26 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.65 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.49 
 
 
327 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.35 
 
 
358 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.15 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.76 
 
 
349 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  42.08 
 
 
312 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.67 
 
 
348 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.6 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.33 
 
 
370 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.76 
 
 
338 aa  91.3  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.86 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.49 
 
 
364 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1490  translation factor SUA5  29.26 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  35.9 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  35.03 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.86 
 
 
348 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.32 
 
 
319 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  31.37 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  35.6 
 
 
318 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.6 
 
 
366 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  35.32 
 
 
367 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.04 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.73 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  36.22 
 
 
331 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.1 
 
 
330 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.1 
 
 
358 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.09 
 
 
312 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  41.18 
 
 
328 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.42 
 
 
317 aa  88.6  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  37.97 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  37.97 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.07 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.61 
 
 
350 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.61 
 
 
350 aa  87.8  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.11 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.04 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.06 
 
 
315 aa  87.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  42.13 
 
 
327 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2757  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
318 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 
193 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  35.64 
 
 
352 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  38.81 
 
 
313 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0766  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.65 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  35.6 
 
 
323 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.79 
 
 
345 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.56 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0276  translation factor SUA5  28.11 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.8 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  37.24 
 
 
315 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.17 
 
 
327 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35 
 
 
324 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.05 
 
 
328 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.78 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.78 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  39.68 
 
 
336 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1769  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.45 
 
 
315 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.72 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1185  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.42 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.909523  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.32 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  37.22 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  35.38 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2454  translation factor SUA5  42.05 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1076  translation factor SUA5  29.63 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1188  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.26 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.04 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>