More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1440 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
183 aa  351  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.76 
 
 
209 aa  127  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0766  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.62 
 
 
206 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1490  translation factor SUA5  40.88 
 
 
205 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1185  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.46 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.909523  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.57 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.97 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1188  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.59 
 
 
205 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.37 
 
 
205 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.67 
 
 
348 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.16 
 
 
350 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.71 
 
 
202 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.11 
 
 
202 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.16 
 
 
350 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.11 
 
 
202 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2454  translation factor SUA5  28 
 
 
212 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.67 
 
 
204 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2757  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.15 
 
 
225 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0579  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.98 
 
 
195 aa  99  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.07 
 
 
335 aa  98.6  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  33.52 
 
 
350 aa  98.2  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28 
 
 
212 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.58 
 
 
202 aa  97.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.23 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.26 
 
 
328 aa  97.1  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.29 
 
 
338 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.81 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  29.26 
 
 
328 aa  97.1  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.59 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0616  translation factor SUA5  32.42 
 
 
306 aa  96.7  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.07 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.53 
 
 
338 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  30.43 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  32.22 
 
 
213 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.52 
 
 
341 aa  94.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  31.07 
 
 
324 aa  94.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.57 
 
 
213 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.73 
 
 
366 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.78 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.995605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  27.68 
 
 
315 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.43 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4849  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.51 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.07 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.05 
 
 
348 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  29.14 
 
 
314 aa  92  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  31.69 
 
 
213 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06115  hypothetical protein  37.86 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.77 
 
 
346 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  29.44 
 
 
203 aa  91.3  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0276  translation factor SUA5  37.64 
 
 
198 aa  90.9  8e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.42 
 
 
317 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  28.96 
 
 
364 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.7 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  31.15 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0562  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35.16 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.440322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.72 
 
 
349 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1234  translation factor SUA5  33.14 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.559123  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  30 
 
 
367 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.83 
 
 
317 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.63 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.55 
 
 
330 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.68 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.67 
 
 
316 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.84 
 
 
359 aa  88.6  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.22 
 
 
345 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
335 aa  88.6  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  29.14 
 
 
335 aa  88.6  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.64 
 
 
346 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0758  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  27.07 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.225685  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  28.98 
 
 
327 aa  88.2  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.94 
 
 
335 aa  88.2  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.59 
 
 
193 aa  88.2  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  28.42 
 
 
323 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.39 
 
 
327 aa  87.8  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.57 
 
 
216 aa  87.8  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.52 
 
 
331 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0460  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.69 
 
 
198 aa  87  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.34 
 
 
246 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0389  Sua5/YciO/YrdC family protein  34.48 
 
 
320 aa  87.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12180  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.64 
 
 
220 aa  86.3  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.821155  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  32.97 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  32.97 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0976  hypothetical protein  31.43 
 
 
323 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.22 
 
 
362 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  27.84 
 
 
333 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.39 
 
 
348 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.07 
 
 
346 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1650  translation factor SUA5  30.43 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.61 
 
 
198 aa  85.1  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.98 
 
 
322 aa  85.1  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  28.8 
 
 
337 aa  85.1  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.07 
 
 
346 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>