More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1427 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  35.08 
 
 
213 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  34 
 
 
213 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.03 
 
 
213 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
341 aa  121  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.94 
 
 
241 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.92 
 
 
338 aa  117  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.16 
 
 
358 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
335 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.68 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
335 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.71 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  33.85 
 
 
350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  31.84 
 
 
337 aa  112  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  33.67 
 
 
351 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1188  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.04 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  29.17 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  29.17 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  29.17 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  34.39 
 
 
367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.69 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.25 
 
 
193 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  30.73 
 
 
352 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1185  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.22 
 
 
206 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.909523  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  31.16 
 
 
327 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.61 
 
 
367 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2757  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.12 
 
 
225 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0326  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.79 
 
 
261 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0766  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.71 
 
 
206 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.04 
 
 
198 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  30.26 
 
 
314 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.02 
 
 
350 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
352 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.02 
 
 
350 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.65 
 
 
366 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1536  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.68 
 
 
198 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34 
 
 
354 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  33.33 
 
 
346 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.37 
 
 
246 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.69 
 
 
348 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.81 
 
 
193 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.78 
 
 
216 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1490  translation factor SUA5  34.87 
 
 
205 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  33.85 
 
 
312 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.16 
 
 
358 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.7 
 
 
329 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.86 
 
 
320 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.79 
 
 
225 aa  104  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.84 
 
 
346 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  31.5 
 
 
327 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.09 
 
 
219 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.65 
 
 
330 aa  104  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0460  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.29 
 
 
198 aa  104  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  34.72 
 
 
342 aa  104  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.12 
 
 
221 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.72 
 
 
338 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.57 
 
 
440 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.12 
 
 
312 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  29.9 
 
 
342 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  30.73 
 
 
335 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  32.18 
 
 
350 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  33.33 
 
 
346 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.85 
 
 
347 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  32.84 
 
 
337 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  30.77 
 
 
216 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.53 
 
 
194 aa  102  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  32.97 
 
 
215 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4337  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.12 
 
 
220 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.0996287 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0276  translation factor SUA5  29.17 
 
 
198 aa  102  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.83 
 
 
346 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
312 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.82 
 
 
346 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.64 
 
 
360 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
326 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0524  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.68 
 
 
332 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.18 
 
 
204 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  29.32 
 
 
251 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4486  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.89 
 
 
296 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  34.04 
 
 
328 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  32.07 
 
 
333 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.99 
 
 
349 aa  101  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.8 
 
 
236 aa  101  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.77 
 
 
345 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0126  translation factor SUA5  32.83 
 
 
315 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  28.35 
 
 
331 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.12 
 
 
205 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  33.33 
 
 
321 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.73 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.63 
 
 
326 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.5 
 
 
327 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.85 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.995605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  29.41 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  30.46 
 
 
322 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.15 
 
 
347 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>