More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1485 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  66.32 
 
 
192 aa  265  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  61.54 
 
 
197 aa  235  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0995  SUA5/yciO/yrdC domain protein  61.98 
 
 
195 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0291721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0225  SUA5/yciO/yrdC domain protein  62 
 
 
200 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  58.46 
 
 
197 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  58.46 
 
 
197 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1864  hypothetical protein  53.61 
 
 
195 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  41.08 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  40.45 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  38.22 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  36.65 
 
 
193 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  40 
 
 
191 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  40 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  42.78 
 
 
199 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1857  hypothetical protein  43.93 
 
 
202 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234672  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  42.25 
 
 
196 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  31.41 
 
 
193 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.47 
 
 
209 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.17 
 
 
338 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35.14 
 
 
315 aa  95.1  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.43 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
350 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
350 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.04 
 
 
216 aa  93.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  36.51 
 
 
350 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.36 
 
 
364 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.75 
 
 
348 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.5 
 
 
360 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.17 
 
 
330 aa  90.5  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  37.3 
 
 
351 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.18 
 
 
317 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.79 
 
 
216 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.64 
 
 
335 aa  88.6  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00384  translation factor  33.86 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.95 
 
 
319 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.37 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.85 
 
 
331 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.86 
 
 
317 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.45 
 
 
346 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.66 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.7 
 
 
354 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.53 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.68 
 
 
343 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  32.29 
 
 
323 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0414  hypothetical protein  32.81 
 
 
280 aa  84.3  9e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.61 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0758  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.22 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.225685  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  33.85 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12180  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.03 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.821155  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2466  Sua5/YciO/YrdC family protein  33.86 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00622558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  34.57 
 
 
328 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
366 aa  81.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.57 
 
 
328 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.68 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.03 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.52 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  32.98 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  29.74 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  34.95 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  29.74 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2757  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.52 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  29.74 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0616  translation factor SUA5  31.75 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.59 
 
 
225 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  32.47 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.24 
 
 
316 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.39 
 
 
352 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.98 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  31.31 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.04 
 
 
345 aa  77.8  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.61 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.64 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268227  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  32.85 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  35.36 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002065  YrdC family protein  32.46 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.694724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  29.67 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0996  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  29.38 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.32 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0977  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  29.38 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.12 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.98 
 
 
367 aa  75.1  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.04 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.29 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.19 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.98 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  31.63 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.79 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3964  SUA5/yciO/yrdC domain protein  33.75 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.87 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2864  SUA5/yciO/yrdC-like protein  29.38 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  29.03 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>