More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1783 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  67.62 
 
 
251 aa  284  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  70.77 
 
 
236 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.02 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  64.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.05 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  58.02 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2350  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.78 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  61.95 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.66 
 
 
338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1207  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.76 
 
 
216 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0326  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.95 
 
 
261 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.96 
 
 
217 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.66 
 
 
221 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0643  translation factor SUA5  56.25 
 
 
219 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1658  Sua5_yciO_yrdC, YrdC domain protein  59.16 
 
 
221 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.02 
 
 
347 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.5 
 
 
215 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  55.56 
 
 
259 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.39 
 
 
216 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.15 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.19 
 
 
219 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  55.1 
 
 
216 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  56.85 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  56.85 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  56.85 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.17 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000551399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3929  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.5 
 
 
258 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.896953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4337  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.76 
 
 
220 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.0996287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.17 
 
 
236 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11328  hypothetical protein  55.85 
 
 
217 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.61 
 
 
224 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  55.32 
 
 
216 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2103  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.54 
 
 
216 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188792  normal  0.0603823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.37 
 
 
440 aa  185  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.38 
 
 
216 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.37 
 
 
216 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  42.25 
 
 
213 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.6 
 
 
213 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  40 
 
 
213 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  43.01 
 
 
328 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.01 
 
 
328 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.49 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.56 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40 
 
 
316 aa  128  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  39.2 
 
 
318 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.55 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.98 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.07 
 
 
346 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  38.17 
 
 
215 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42 
 
 
337 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.75 
 
 
345 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.92 
 
 
346 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.98 
 
 
364 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42 
 
 
337 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.31 
 
 
335 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.9 
 
 
317 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  39.46 
 
 
351 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  41.15 
 
 
336 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35 
 
 
346 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
366 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.01 
 
 
349 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1897  putative translation factor  38 
 
 
224 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.68 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.29 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.69 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.49 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.53 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  34.55 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  36.73 
 
 
367 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.05 
 
 
341 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.44 
 
 
354 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.76 
 
 
370 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  38.89 
 
 
330 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  35.44 
 
 
350 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.83 
 
 
359 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  41.67 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.76 
 
 
335 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative  39.45 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5091  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.89 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.25 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.45 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.51 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  45.36 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.3 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.43 
 
 
196 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.17 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.6 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  37.63 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>