More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2457 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
236 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  68.63 
 
 
236 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.05 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  63.9 
 
 
251 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.31 
 
 
241 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.91 
 
 
338 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  49.79 
 
 
245 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11328  hypothetical protein  53.43 
 
 
217 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.67 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  59.79 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2350  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.79 
 
 
266 aa  194  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.83 
 
 
347 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.46 
 
 
219 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.93 
 
 
215 aa  191  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1207  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.92 
 
 
216 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  52.88 
 
 
216 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  47.88 
 
 
259 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.22 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4337  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.47 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.0996287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  52.11 
 
 
244 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1658  Sua5_yciO_yrdC, YrdC domain protein  50.98 
 
 
221 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  51.71 
 
 
218 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  51.71 
 
 
218 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  51.71 
 
 
218 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.66 
 
 
440 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.52 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0643  translation factor SUA5  53.02 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  49.51 
 
 
216 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0326  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.54 
 
 
261 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50 
 
 
236 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.94 
 
 
214 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000551399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3929  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.55 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.896953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2103  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.85 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188792  normal  0.0603823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.05 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.04 
 
 
217 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.06 
 
 
216 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.52 
 
 
216 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.88 
 
 
355 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.86 
 
 
345 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.88 
 
 
356 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.75 
 
 
205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  40 
 
 
213 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.84 
 
 
348 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.48 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.2 
 
 
346 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.78 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.29 
 
 
364 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.53 
 
 
354 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.72 
 
 
370 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  41.44 
 
 
321 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.38 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.02 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  36.71 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  35.27 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.82 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.98 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.23 
 
 
346 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.68 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.63 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  36.32 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  36.59 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.52 
 
 
326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.8 
 
 
328 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  39.8 
 
 
328 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41 
 
 
358 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  37.84 
 
 
213 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  39.18 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.5 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  36.84 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  34.85 
 
 
342 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  34.4 
 
 
367 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.98 
 
 
318 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  44 
 
 
322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.27 
 
 
193 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.58 
 
 
352 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  35.23 
 
 
350 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  34.88 
 
 
337 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  36.15 
 
 
321 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.32 
 
 
335 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  41.46 
 
 
331 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.26 
 
 
337 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.41 
 
 
316 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.78 
 
 
331 aa  104  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.38 
 
 
335 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.26 
 
 
359 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.23 
 
 
358 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  36.96 
 
 
336 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.32 
 
 
358 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.75 
 
 
347 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  32.32 
 
 
325 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.37 
 
 
337 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  38.54 
 
 
328 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.1 
 
 
338 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.29 
 
 
341 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>