More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1782 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  100 
 
 
337 aa  690    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  54.19 
 
 
337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  53.06 
 
 
342 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  49.26 
 
 
334 aa  315  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.95 
 
 
348 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.35 
 
 
346 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.26 
 
 
347 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.1 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.74 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.27 
 
 
354 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  40.86 
 
 
351 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  42.2 
 
 
350 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.9 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.63 
 
 
359 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.82 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.24 
 
 
354 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.87 
 
 
352 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  40.34 
 
 
352 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.4 
 
 
350 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.4 
 
 
350 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.53 
 
 
346 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.37 
 
 
335 aa  228  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.06 
 
 
335 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.87 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.68 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.94 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  38.91 
 
 
323 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.24 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.87 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.56 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.58 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.19 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.86 
 
 
338 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.94 
 
 
360 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.24 
 
 
366 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.65 
 
 
357 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.65 
 
 
357 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  40.74 
 
 
350 aa  209  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.31 
 
 
345 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.78 
 
 
344 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.94 
 
 
335 aa  209  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.73 
 
 
331 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.36 
 
 
324 aa  208  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.04 
 
 
326 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.15 
 
 
315 aa  208  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3049  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.92 
 
 
323 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.268552  normal  0.430459 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3060  translation factor SUA5  40.38 
 
 
323 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.12 
 
 
318 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  38.82 
 
 
387 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.65 
 
 
326 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.21 
 
 
358 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.72 
 
 
358 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1773  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.79 
 
 
344 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.98 
 
 
345 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.3 
 
 
355 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.82 
 
 
328 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.45 
 
 
331 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  38.07 
 
 
342 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  38.11 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.04 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.88 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.34 
 
 
322 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.18 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.8 
 
 
312 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10771  translation initiation protein Sua5 (AFU_orthologue; AFUA_2G09160)  36.36 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0142464  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  38.48 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  36.16 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  36.84 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.79 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.74 
 
 
356 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  36.28 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.21 
 
 
327 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0445  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.51 
 
 
328 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.05 
 
 
327 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.69 
 
 
330 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  41.25 
 
 
333 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0524  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.34 
 
 
332 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.75 
 
 
367 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.52 
 
 
349 aa  192  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2842  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.3 
 
 
335 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.88 
 
 
329 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  40.95 
 
 
328 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.11 
 
 
343 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  39.01 
 
 
327 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0976  hypothetical protein  38.74 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.71 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3830  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
332 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1132  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.69 
 
 
329 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2369  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.75 
 
 
330 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  38.48 
 
 
313 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.31 
 
 
324 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>