More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03441 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  90.16 
 
 
193 aa  357  4e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  86.53 
 
 
193 aa  342  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  59.26 
 
 
193 aa  230  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  47.67 
 
 
196 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  46.15 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  46.15 
 
 
199 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  42.37 
 
 
199 aa  151  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1864  hypothetical protein  38.46 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1857  hypothetical protein  41.57 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234672  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  38.3 
 
 
196 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  38.22 
 
 
194 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0995  SUA5/yciO/yrdC domain protein  40.34 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0291721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  37.56 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  40.11 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  40.11 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  37.63 
 
 
192 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0225  SUA5/yciO/yrdC domain protein  35.68 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12180  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.79 
 
 
220 aa  95.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.821155  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
246 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.33 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.77 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.35 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.01 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  29.17 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  30.57 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.61 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  30.11 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  31.18 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  32.24 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0414  hypothetical protein  30.69 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.6 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4337  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.63 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.0996287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.82 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  31.44 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2289  translation factor SUA5  26.9 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.12 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.53 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.58 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.77 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.44 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11328  hypothetical protein  34.29 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.87 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000551399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.1 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  27.42 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0029  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.864856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.25 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0404  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.16 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.459689  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.56 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  30.69 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.55 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  30.69 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.89 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  30.69 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3964  SUA5/yciO/yrdC domain protein  29.66 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0036  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.48 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.51 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.88 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  28.21 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.48 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0036  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.48 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000077729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0032  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.48 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0844  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.65 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.021666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00384  translation factor  29.17 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4507  putative ribosome maturation factor  28.08 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000123843  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.85 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.93 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.95 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3785  SUA5/yciO/yrdC domain protein  28.97 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000349894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.89 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0320  putative ribosome maturation factor  30.99 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00340055  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  27.6 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.37 
 
 
352 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.57 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3592  SUA5/yciO/yrdC domain  30 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.423964  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  28.96 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0621  putative ribosome maturation factor  30.99 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000135377  normal  0.0218454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3878  putative ribosome maturation factor  30.99 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000521724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.38 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.34 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.51 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.44 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0643  translation factor SUA5  31.65 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.07 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0034  translation factor SUA5  28.89 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.12599  hitchhiker  0.00900731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0032  translation factor SUA5  28.89 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.86833  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.72 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0040  translation factor SUA5  28.89 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123848  hitchhiker  0.00000448294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  29.38 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002065  YrdC family protein  29.66 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.694724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.88 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1897  putative translation factor  28.22 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.15 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.76 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.3 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3476  putative ribosome maturation factor  29.05 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000439267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03084  hypothetical protein  29.05 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.017933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3765  putative ribosome maturation factor  29.05 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000551499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>