More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0477 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1857  hypothetical protein  62.56 
 
 
202 aa  228  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234672  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  46.35 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  49.18 
 
 
191 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  49.18 
 
 
199 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  54.45 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1864  hypothetical protein  48.88 
 
 
195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  42.37 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  42.78 
 
 
193 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  39.38 
 
 
193 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  42.37 
 
 
193 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0995  SUA5/yciO/yrdC domain protein  43.46 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0291721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  42.08 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  40.78 
 
 
192 aa  118  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.33 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.33 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  42.78 
 
 
194 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0225  SUA5/yciO/yrdC domain protein  42.55 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.45 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.78 
 
 
348 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.84 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.59 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.15 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36 
 
 
347 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.81 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0481  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.38 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.01 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.62 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  33.33 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.06 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  34.41 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.32 
 
 
330 aa  71.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1897  putative translation factor  33.51 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  37.31 
 
 
335 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.97 
 
 
246 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.52 
 
 
347 aa  71.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4486  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.04 
 
 
296 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.07 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.1 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0126  translation factor SUA5  34.41 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  31.11 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  31.66 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  37.84 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.24 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  36.76 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  32.97 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.07 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.11 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.31 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0414  hypothetical protein  32.63 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  31.35 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  32.02 
 
 
387 aa  68.2  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4920  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.84 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.706682  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0996  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  26.26 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  32.11 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0977  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  26.26 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.67 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.79 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  31.02 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.88 
 
 
317 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.3 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.67 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.69 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  28.96 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.49 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  34.83 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0389  Sua5/YciO/YrdC family protein  30.53 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  37.4 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0976  hypothetical protein  35.26 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.56 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.36 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  32.98 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  34.51 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.03 
 
 
354 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  32.89 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.12 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  28.42 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1650  translation factor SUA5  36.22 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0435  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 
316 aa  64.7  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  32.98 
 
 
314 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.13 
 
 
357 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
350 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0748  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.2 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.13 
 
 
357 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10771  translation initiation protein Sua5 (AFU_orthologue; AFUA_2G09160)  35.5 
 
 
427 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0142464  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.76 
 
 
349 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  29.27 
 
 
325 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
350 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.39 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>