More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03541 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  56.61 
 
 
196 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  49.74 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  49.74 
 
 
199 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  47.67 
 
 
193 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  47.67 
 
 
193 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  47.67 
 
 
193 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  49.44 
 
 
193 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1857  hypothetical protein  45.03 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  46.35 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1864  hypothetical protein  46.45 
 
 
195 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  40.41 
 
 
197 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  41.08 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0995  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.75 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0291721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  39.01 
 
 
192 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2630  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.49 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3473  SUA5/yciO/yrdC domain protein  41.49 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000450966  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0225  SUA5/yciO/yrdC domain protein  42.22 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.5 
 
 
338 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  32.4 
 
 
318 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  35.6 
 
 
213 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.44 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  33.67 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.61 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1650  translation factor SUA5  36.23 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.85 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.41 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  33.67 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  31.68 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
319 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.68 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.98 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0404  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.28 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.459689  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.69 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.95 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  31.58 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0414  hypothetical protein  29.63 
 
 
280 aa  74.7  0.0000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.38 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.51 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1490  translation factor SUA5  33.52 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0758  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35.75 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.225685  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0715  translation factor SUA5  31.19 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3730  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.26 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0238268  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.32 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  32.17 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.09 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.38 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.377079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0037  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  31.37 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.8 
 
 
343 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0360  SUA5/yciO/yrdC domain protein  33.33 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.84 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.09 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.26 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  28.96 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  28.96 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0766  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.82 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1188  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  33.66 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  31.91 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.53 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0029  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  30.28 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.480067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.14 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.47 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.99 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  32.67 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  30.77 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.75 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3785  SUA5/yciO/yrdC domain protein  31.82 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000349894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  31.65 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  29.03 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0389  Sua5/YciO/YrdC family protein  31.58 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.17 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.62 
 
 
331 aa  67.8  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32 
 
 
312 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00384  translation factor  29.66 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2454  translation factor SUA5  32.04 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0046  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.66 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  30.69 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0072  ribosome maturation factor  28.31 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.33 
 
 
312 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.17 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.59 
 
 
440 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0082  hypothetical protein  32.59 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  35.16 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.57 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.05 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.09 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.37 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4507  putative ribosome maturation factor  30.77 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000123843  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.16 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.08 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.08 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>