More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0231 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
349 aa  706    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.89 
 
 
324 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  55.14 
 
 
325 aa  346  3e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  57.05 
 
 
321 aa  346  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.54 
 
 
327 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.12 
 
 
316 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.88 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.43 
 
 
331 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.88 
 
 
323 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0224928  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.58 
 
 
312 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  46.27 
 
 
312 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0405  Sua5/YciO/YrdC family protein  46.35 
 
 
323 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0414  Sua5/YciO/YrdC family protein  46.03 
 
 
323 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3060  translation factor SUA5  44.44 
 
 
323 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  44.27 
 
 
322 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  44.51 
 
 
327 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  44.44 
 
 
314 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0020  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.77 
 
 
317 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857779  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.95 
 
 
326 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0389  Sua5/YciO/YrdC family protein  44.27 
 
 
320 aa  224  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2842  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.44 
 
 
335 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0435  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.71 
 
 
316 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0524  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.76 
 
 
332 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0227  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.19 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.54 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373463  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0481  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.95 
 
 
324 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0715  translation factor SUA5  45.43 
 
 
318 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.07 
 
 
347 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0445  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.56 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.49 
 
 
364 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0269  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.96 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000257008  normal  0.95285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  44.66 
 
 
333 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0976  hypothetical protein  41.09 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  46.01 
 
 
328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  41.67 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.67 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  39.94 
 
 
321 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.28 
 
 
329 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.63 
 
 
320 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0594  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.55 
 
 
324 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120581  normal  0.895593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.73 
 
 
344 aa  209  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.81 
 
 
345 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.24 
 
 
346 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.95 
 
 
330 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4486  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.55 
 
 
296 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  39.25 
 
 
329 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1132  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44.62 
 
 
329 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.94 
 
 
348 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.72 
 
 
346 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.52 
 
 
326 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  36.94 
 
 
352 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3830  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.45 
 
 
332 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  40.31 
 
 
322 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.42 
 
 
329 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.04 
 
 
346 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  40.31 
 
 
322 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.94 
 
 
328 aa  203  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.62 
 
 
346 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.73 
 
 
346 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  42.24 
 
 
313 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  37.73 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.03 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.09 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 
338 aa  199  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.89 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  42.05 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.63 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  39.45 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.58 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2369  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.95 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3049  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.81 
 
 
323 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.268552  normal  0.430459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.86 
 
 
316 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.56 
 
 
341 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2651  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.32 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654843  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  34.9 
 
 
351 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2011  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.32 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.39 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2622  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.32 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378273  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  36.42 
 
 
342 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.36 
 
 
354 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2542  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.39 
 
 
342 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636354  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5953  translation factor SUA5  38.01 
 
 
342 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.31 
 
 
350 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  38.8 
 
 
350 aa  192  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.31 
 
 
350 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  39.1 
 
 
342 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.7 
 
 
356 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.69 
 
 
359 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0676  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.39 
 
 
342 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.96 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  38.11 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  38.05 
 
 
335 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>