More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0598 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  44.73 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.73 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44 
 
 
364 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.06 
 
 
370 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  42.24 
 
 
328 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.27 
 
 
362 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  42.55 
 
 
331 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  41.43 
 
 
330 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3284  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.69 
 
 
332 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  43.96 
 
 
335 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3936  translation factor SUA5  43.69 
 
 
332 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182526  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  42.59 
 
 
331 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.81 
 
 
327 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2011  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  43.33 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2622  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.33 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3271  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.59 
 
 
346 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.917971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2651  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.33 
 
 
342 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654843  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  38.12 
 
 
325 aa  218  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0676  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.72 
 
 
342 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.88 
 
 
337 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.88 
 
 
337 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.47 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2542  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.47 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636354  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.56 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0695  translation factor SUA5  40.55 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274507  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  41.99 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5091  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.66 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.33 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5953  translation factor SUA5  42.54 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  40.57 
 
 
321 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.42 
 
 
324 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.46 
 
 
358 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.54 
 
 
327 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.51 
 
 
331 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.69 
 
 
348 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.88 
 
 
346 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  39.43 
 
 
346 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1544  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.95 
 
 
348 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.58 
 
 
358 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  38.97 
 
 
352 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.25 
 
 
349 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0465  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.84 
 
 
347 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  42.06 
 
 
336 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.42 
 
 
348 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.61 
 
 
347 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  38.29 
 
 
346 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.68 
 
 
345 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 
341 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.91 
 
 
316 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  39.69 
 
 
321 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  35.56 
 
 
351 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0195  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.8 
 
 
389 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  36.36 
 
 
350 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.01 
 
 
316 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0988  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.68 
 
 
332 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  36.79 
 
 
322 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  36.48 
 
 
322 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  36.89 
 
 
350 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2023  translation factor SUA5  41.07 
 
 
339 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.111129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative  40.19 
 
 
342 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
342 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.29 
 
 
349 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.24 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.73 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  39.75 
 
 
314 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.09 
 
 
318 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  43.03 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.85 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.37 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.46 
 
 
330 aa  195  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.13 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.36 
 
 
354 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.99 
 
 
358 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.64 
 
 
312 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.63 
 
 
329 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.11 
 
 
347 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4564  translation factor SUA5  40.72 
 
 
336 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.82 
 
 
312 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.91 
 
 
356 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.92 
 
 
341 aa  192  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.09 
 
 
315 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.55 
 
 
352 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 
348 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.34 
 
 
349 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.92 
 
 
324 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.64 
 
 
366 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.99 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>