96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0264 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  45.57 
 
 
322 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  46.91 
 
 
315 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  46.77 
 
 
317 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  43.75 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  43.77 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  42.17 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  41.77 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  41.77 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  42.48 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  41.94 
 
 
316 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  44.01 
 
 
320 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  39.75 
 
 
321 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  40.06 
 
 
325 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  41.94 
 
 
316 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  41.29 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  39.3 
 
 
313 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  42.39 
 
 
320 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  41.98 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  39.29 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  39.29 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  40.13 
 
 
314 aa  209  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  38.91 
 
 
317 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  36.01 
 
 
308 aa  206  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  36.42 
 
 
310 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  39.24 
 
 
313 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  39.16 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  35.78 
 
 
313 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  37.34 
 
 
327 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  32.47 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  38.29 
 
 
306 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  36.69 
 
 
305 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  175  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  175  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  33.77 
 
 
303 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  30.72 
 
 
300 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  30.48 
 
 
315 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  28.62 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  31.48 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  29.93 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  29.18 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  35.36 
 
 
308 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  29.28 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  29.61 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  28.95 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  30.92 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  29.93 
 
 
328 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  27.3 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0020  protein of unknown function DUF199  27.65 
 
 
296 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl066  hypothetical protein  28.71 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  28.9 
 
 
303 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  29.28 
 
 
326 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  29.93 
 
 
326 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  29.61 
 
 
331 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  29.61 
 
 
326 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  36.02 
 
 
306 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  29.84 
 
 
328 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  27.96 
 
 
326 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  31.49 
 
 
326 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  30.59 
 
 
326 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  29.55 
 
 
326 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  27.96 
 
 
332 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  28.62 
 
 
321 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  28.29 
 
 
326 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  29.28 
 
 
328 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  28.48 
 
 
385 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  30.52 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  23.57 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  29.61 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  27.21 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  28.29 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  28.29 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  28.85 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  29.28 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  28.48 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  27.81 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  28.38 
 
 
325 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  85.9  9e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  29.18 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  29.84 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0156  hypothetical protein  28.08 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.376182  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  27.01 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  29.74 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>