96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0116 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  634    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  58.79 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  54.63 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  48.41 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  50.96 
 
 		 317 aa  291  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  48.56 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  48.08 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  46.18 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  47.76 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  48.1 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  47.78 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  48.28 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  47.78 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  45.19 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  45.34 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  45.34 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  49.15 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  44.98 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  42.17 
 
 		 313 aa  255  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  43.41 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  44.13 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  43.31 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  42.27 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  43.14 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  40.44 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  39.81 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  41.04 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  38.94 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  38.76 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  36.98 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  38.19 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  35.9 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  36.66 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  33.65 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  34.52 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  33.44 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  33.12 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  31.07 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  31.83 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  28.66 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  29.64 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  28.85 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0020  protein of unknown function DUF199  29.45 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  30.13 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  29.3 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  29.47 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  32.79 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  28.01 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  28.66 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  28.66 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  29.52 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  29.52 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  30.62 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl066  hypothetical protein  29.25 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  29.9 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  28.9 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  29.58 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  26.47 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  28.75 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  29.39 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  30.28 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  28.25 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0156  hypothetical protein  33.87 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.376182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  29.52 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  27.74 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  27.74 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  27.55 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  27.69 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  28.94 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  32.64 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  30.19 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  30.52 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  28.48 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  28.01 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  29.94 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  26.62 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  28.12 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  30.46 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  26.96 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  27.65 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>