93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2362 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  100 
 
 
327 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  84.66 
 
 
328 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  85.49 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  85.19 
 
 
325 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  84.57 
 
 
325 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  84.57 
 
 
325 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  84.57 
 
 
325 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  83.33 
 
 
325 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  78.22 
 
 
328 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  74.23 
 
 
326 aa  474  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  73.31 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  78.15 
 
 
326 aa  457  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  78.29 
 
 
328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  76.69 
 
 
326 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  75.69 
 
 
326 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  74.77 
 
 
326 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  75.08 
 
 
326 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  73.54 
 
 
326 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  74.69 
 
 
326 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  75 
 
 
326 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  73.7 
 
 
328 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  73.54 
 
 
326 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  74.77 
 
 
328 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  71.3 
 
 
332 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  71.21 
 
 
324 aa  411  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  72.7 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  70.37 
 
 
326 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  68.55 
 
 
321 aa  401  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  72.22 
 
 
326 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  71.6 
 
 
326 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  72.92 
 
 
331 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  71.91 
 
 
326 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  74.07 
 
 
326 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  72.92 
 
 
326 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  66.88 
 
 
385 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  72.31 
 
 
345 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  47.3 
 
 
315 aa  251  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  47.91 
 
 
316 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  29.3 
 
 
314 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  31.37 
 
 
317 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  28.21 
 
 
318 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  28.21 
 
 
314 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  28.21 
 
 
314 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  27.97 
 
 
314 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  31.94 
 
 
310 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  28.9 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  31.41 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  29.45 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  29.84 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  28.48 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  28.48 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  28.12 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  28.66 
 
 
322 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  29.45 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  28.43 
 
 
320 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  27.24 
 
 
316 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  24.84 
 
 
313 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  26.84 
 
 
321 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  28.16 
 
 
305 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  32.14 
 
 
306 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  28.99 
 
 
315 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  24.6 
 
 
303 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  30.74 
 
 
315 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  26.03 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  24.43 
 
 
303 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  29.25 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  23.32 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  26.73 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  27.47 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  26.47 
 
 
308 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  27.01 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  28.53 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  32.02 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  23.9 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  27.56 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  26.47 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  28.85 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  26.84 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  26.84 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  32.04 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  17.79 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  25.16 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>