96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1313 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  641    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  57.61 
 
 
313 aa  368  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  56.31 
 
 
320 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  55.34 
 
 
316 aa  346  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  55.34 
 
 
316 aa  342  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  55.34 
 
 
316 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  55.81 
 
 
314 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  54.69 
 
 
320 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  55.02 
 
 
316 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  54.52 
 
 
314 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  54.52 
 
 
314 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  55.9 
 
 
301 aa  324  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  45.11 
 
 
327 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  42.99 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  48.72 
 
 
314 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  43.71 
 
 
316 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  43.71 
 
 
316 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  44.97 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  42.86 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  41.48 
 
 
321 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  43.71 
 
 
303 aa  239  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  39.29 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  42.81 
 
 
315 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  42.27 
 
 
314 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  40.13 
 
 
315 aa  227  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  39.74 
 
 
305 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  37.42 
 
 
313 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  39.55 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  36.39 
 
 
313 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  37.03 
 
 
325 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  36.81 
 
 
313 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  34.08 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  34.08 
 
 
308 aa  172  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  37.11 
 
 
315 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  33.87 
 
 
317 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  34.94 
 
 
307 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  33.23 
 
 
322 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl066  hypothetical protein  33.23 
 
 
317 aa  140  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  31.19 
 
 
306 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  30.84 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  28.39 
 
 
309 aa  132  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  29.49 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0020  protein of unknown function DUF199  29.38 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  31.15 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  31.63 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  28.89 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  31.63 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  26.69 
 
 
326 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  29.17 
 
 
328 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  26.37 
 
 
326 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  29.84 
 
 
326 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  33.33 
 
 
306 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  26.98 
 
 
332 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0156  hypothetical protein  32.26 
 
 
306 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.376182  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  27.01 
 
 
321 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  27.65 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  32.39 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  27.8 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  28.57 
 
 
326 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  29.84 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  29.21 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  28.85 
 
 
325 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  28.06 
 
 
331 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  28.85 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  28.25 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  29.51 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  28.57 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  29.04 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  28.53 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  28.99 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  28.8 
 
 
328 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  27.36 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  28.38 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  28.85 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  27.83 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  29.04 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  25.32 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  27.51 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  28.2 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  26.37 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  27.87 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  29.51 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  27.36 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  27.62 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  30.6 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  25.45 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>