93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5609 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  100 
 
 
385 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  69.72 
 
 
326 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  69.72 
 
 
326 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  67.99 
 
 
328 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  70.35 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  71.92 
 
 
328 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  70.03 
 
 
326 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  70.03 
 
 
326 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  70.35 
 
 
326 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  70.98 
 
 
326 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  65.62 
 
 
332 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  73.19 
 
 
326 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  69.4 
 
 
328 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  70.35 
 
 
326 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  70.98 
 
 
326 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  72.24 
 
 
326 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  69.72 
 
 
326 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  70.95 
 
 
326 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  69.09 
 
 
326 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  69.06 
 
 
328 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  68.77 
 
 
326 aa  378  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  71.12 
 
 
326 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  62.42 
 
 
321 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  71.56 
 
 
326 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  67.62 
 
 
325 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  66.56 
 
 
328 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  67.62 
 
 
325 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  67.62 
 
 
325 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  66.88 
 
 
327 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  67.62 
 
 
325 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  66.15 
 
 
325 aa  363  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  67.62 
 
 
325 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  67.21 
 
 
326 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  66.98 
 
 
331 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  69.47 
 
 
345 aa  335  5e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  64.17 
 
 
326 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  47.4 
 
 
315 aa  241  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  45.63 
 
 
316 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  32.04 
 
 
320 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  29.77 
 
 
315 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  29.97 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  29.56 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  35.46 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  29.13 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  30.28 
 
 
314 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  30.48 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  27.48 
 
 
314 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  27.48 
 
 
314 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  27.33 
 
 
321 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  33.01 
 
 
310 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  26.54 
 
 
314 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  27.18 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  25.4 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  27.83 
 
 
316 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  32.14 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  27.18 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  26.9 
 
 
316 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  26.9 
 
 
316 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  29.08 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  27.65 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  27.74 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  29.55 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  30.55 
 
 
307 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  28.38 
 
 
313 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  24.6 
 
 
318 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  29.15 
 
 
327 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  27.18 
 
 
313 aa  105  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  31.27 
 
 
306 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  25.72 
 
 
313 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  29.45 
 
 
315 aa  99.8  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  25.16 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  25.17 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  30.93 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  24.74 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  24.74 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  25.62 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  30.1 
 
 
306 aa  63.5  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  34.76 
 
 
226 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  22.12 
 
 
329 aa  57  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  20.55 
 
 
309 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  22.29 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  28.18 
 
 
284 aa  43.1  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>