95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0909 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  634    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  67.85 
 
 
316 aa  381  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  49.03 
 
 
332 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  50.49 
 
 
326 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  49.19 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  49.51 
 
 
326 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  48.54 
 
 
321 aa  248  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  49.02 
 
 
326 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  49.84 
 
 
328 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  50.16 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  50.66 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  48.03 
 
 
326 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  51.57 
 
 
325 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  51.57 
 
 
325 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  51.57 
 
 
325 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  49.84 
 
 
328 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  50 
 
 
326 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  48.53 
 
 
328 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  47.3 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  46.79 
 
 
326 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  50.35 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  49.02 
 
 
325 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  48.21 
 
 
328 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  47.4 
 
 
385 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  47.88 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  49.35 
 
 
324 aa  225  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  46.41 
 
 
326 aa  225  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  47.56 
 
 
326 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  47.56 
 
 
328 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  48.38 
 
 
326 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  50.16 
 
 
331 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  47.39 
 
 
326 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  48.05 
 
 
326 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  47.4 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  46.75 
 
 
326 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  49.03 
 
 
326 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  45.81 
 
 
345 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  27.93 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  27.93 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  28.94 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  28.97 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  31.09 
 
 
308 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  29.47 
 
 
318 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  28.84 
 
 
310 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  26.37 
 
 
320 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  30.48 
 
 
303 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  26.11 
 
 
320 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  23.99 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  28.44 
 
 
308 aa  99  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  26.03 
 
 
314 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  26.03 
 
 
314 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  26.53 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  23.34 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  22.41 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  24.45 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  25.32 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  32.07 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  28.42 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  28.3 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  27.72 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  28.91 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  25.26 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  25.61 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  25.34 
 
 
301 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  25.32 
 
 
316 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  24.68 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  29.48 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  28.57 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  22.86 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  29.17 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  30 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  30.39 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  21.52 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  29.89 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0020  protein of unknown function DUF199  27.12 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  28.49 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  23.24 
 
 
291 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  23.24 
 
 
291 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  25.97 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  23.1 
 
 
309 aa  52.8  0.000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  28.39 
 
 
284 aa  52  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  32.62 
 
 
226 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0156  hypothetical protein  23.4 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.376182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>