93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  634    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  84.45 
 
 		 328 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  81.85 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  72.7 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  72.39 
 
 		 326 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  79.75 
 
 		 326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  77.98 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  77.85 
 
 		 325 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  77.85 
 
 		 325 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  77.85 
 
 		 325 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  78.15 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  78.7 
 
 		 326 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  77.54 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  75.15 
 
 		 328 aa  454  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  78.4 
 
 		 326 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  78.77 
 
 		 325 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  74.46 
 
 		 326 aa  448  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  74.46 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  74.15 
 
 		 326 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  75.15 
 
 		 328 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  75.15 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  72.92 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  73.99 
 
 		 324 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  76.54 
 
 		 326 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  72.62 
 
 		 326 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  75.93 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  73.77 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  74.23 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  75.62 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  78.4 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  66.97 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  75.15 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  68.55 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  67.99 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  72 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  75 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  46.93 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  48.39 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  31.83 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  31.05 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  34.42 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  34.94 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  28.62 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  27.56 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  28.48 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  31.95 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  26.62 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  27.94 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  25.96 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  25.65 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  27.13 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  27.13 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  27.13 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  29.87 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  26.54 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  26.2 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  30.74 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  27.65 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  26.58 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  25.87 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  26.86 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  27.92 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  31.21 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  24.18 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  25.65 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  26.42 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  28.92 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  23.13 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  27.97 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  29.32 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  26.85 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  29.02 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  26.43 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  21.03 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  25.16 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  25.16 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  31.31 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  26.92 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  24.12 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  32.8 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  26.28 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>