95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2006 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  33.52 
 
 
316 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  33.52 
 
 
316 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  34.21 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  28.18 
 
 
318 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  34.24 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  35.48 
 
 
315 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  33.7 
 
 
320 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  36.96 
 
 
315 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  37.29 
 
 
317 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  32.79 
 
 
316 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  32.79 
 
 
314 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  30.73 
 
 
325 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  31.69 
 
 
314 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  31.69 
 
 
314 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  34.46 
 
 
314 aa  101  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  36.31 
 
 
313 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  34.08 
 
 
327 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  34.44 
 
 
308 aa  98.6  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  33.15 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  29.83 
 
 
313 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  30.39 
 
 
321 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  31.15 
 
 
313 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  33.14 
 
 
305 aa  92.4  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  30.56 
 
 
313 aa  92  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  32.97 
 
 
307 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  33.88 
 
 
310 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  30.6 
 
 
315 aa  90.5  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  31.25 
 
 
315 aa  85.9  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  30.6 
 
 
303 aa  81.6  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0020  protein of unknown function DUF199  25.53 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  30.56 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  37.22 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  34.82 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  35.11 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  23.04 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  27.07 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  27.07 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  34.96 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0156  hypothetical protein  24.31 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.376182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  33.68 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  24.43 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  34.06 
 
 
328 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  36.31 
 
 
326 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  35.56 
 
 
326 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  33.77 
 
 
332 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  21.89 
 
 
329 aa  62.4  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  36.28 
 
 
326 aa  61.6  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  27.17 
 
 
322 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  32.62 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  34.59 
 
 
385 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl066  hypothetical protein  22.28 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  30.41 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  34.38 
 
 
328 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  34.9 
 
 
321 aa  59.3  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  22.22 
 
 
309 aa  58.9  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  36.27 
 
 
326 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  35.43 
 
 
326 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  33.78 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  36.11 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  35.2 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  35.79 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  35.24 
 
 
326 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  20.51 
 
 
284 aa  55.5  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  36.72 
 
 
345 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  34.07 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  32.89 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  34.25 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  32.46 
 
 
325 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  32.33 
 
 
327 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  35.56 
 
 
326 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  32.47 
 
 
331 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  33.33 
 
 
326 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  34.22 
 
 
326 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  31.87 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  35.29 
 
 
326 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  32.75 
 
 
326 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>