93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2045 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2045  protein of unknown function DUF199  100 
 
 
326 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15810  hypothetical protein  79.75 
 
 
328 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140431  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2085  hypothetical protein  73.01 
 
 
326 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.227753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2799  protein of unknown function DUF199  78.4 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000867405  decreased coverage  0.00000150657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1826  protein of unknown function DUF199  72.39 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2172  protein of unknown function DUF199  76.85 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5203  protein of unknown function DUF199  77.16 
 
 
328 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3326  hypothetical protein  76.31 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3099  hypothetical protein  76 
 
 
326 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2529  hypothetical protein  75.31 
 
 
328 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2362  protein of unknown function DUF199  76.69 
 
 
327 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1944  protein of unknown function DUF199  74.69 
 
 
326 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1636  hypothetical protein  75.54 
 
 
328 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2932  protein of unknown function DUF199  75.31 
 
 
326 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1255  protein of unknown function DUF199  74.38 
 
 
326 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11452  transcriptional regulatory protein whiA  76.4 
 
 
325 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20040  hypothetical protein  73.77 
 
 
326 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37166  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2445  hypothetical protein  75.16 
 
 
325 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2439  hypothetical protein  75.16 
 
 
325 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2398  hypothetical protein  75.16 
 
 
325 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2542  protein of unknown function DUF199  73.77 
 
 
328 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1994  hypothetical protein  76.07 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.893655  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2018  hypothetical protein  75.38 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.296279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2700  hypothetical protein  74.53 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747531  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3712  hypothetical protein  74.84 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6039  hypothetical protein  76.23 
 
 
326 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15190  hypothetical protein  68.52 
 
 
332 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1113  hypothetical protein  69.35 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404058  normal  0.148231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3011  protein of unknown function DUF199  75.69 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0646248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2197  protein of unknown function DUF199  78.09 
 
 
326 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11330  conserved hypothetical protein TIGR00647  67.82 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.26684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2062  hypothetical protein  73.99 
 
 
331 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5609  protein of unknown function DUF199  70.98 
 
 
385 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2978  hypothetical protein  69.23 
 
 
326 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13100  hypothetical protein  74.77 
 
 
345 aa  360  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1547  protein of unknown function DUF199  69.44 
 
 
326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0909  hypothetical protein  46.79 
 
 
315 aa  248  7e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0431  hypothetical protein  46.93 
 
 
316 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4720  protein of unknown function DUF199  31.7 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0116  hypothetical protein  28.66 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.061515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1781  protein of unknown function DUF199  34.6 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0435  hypothetical protein  27.3 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3939  protein of unknown function DUF199  27.24 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000093648  normal  0.595989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07120  hypothetical protein  32.59 
 
 
308 aa  119  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15860  conserved hypothetical protein TIGR00647  27.16 
 
 
313 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0808  hypothetical protein  27.62 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0792  hypothetical protein  27.62 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0337  hypothetical protein  27.53 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0345  hypothetical protein  27.53 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1189  hypothetical protein  25.88 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3145  protein of unknown function DUF199  27.83 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0388  hypothetical protein  27.16 
 
 
313 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10640  hypothetical protein  30.72 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0387663  hitchhiker  0.0000000259024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3696  hypothetical protein  26.3 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2994  hypothetical protein  29.87 
 
 
322 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1313  hypothetical protein  28.2 
 
 
313 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000241288  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5272  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00634924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5685  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.940804  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5257  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5238  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5314  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5002  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4831  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5382  hypothetical protein  26.62 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2968  protein of unknown function DUF199  27.65 
 
 
320 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0301  hypothetical protein  32.26 
 
 
315 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4946  hypothetical protein  25.97 
 
 
316 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.586503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2021  protein of unknown function DUF199  26.52 
 
 
321 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0264  hypothetical protein  28.8 
 
 
315 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0674  protein of unknown function DUF199  24.74 
 
 
300 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0164188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4846  hypothetical protein  26.53 
 
 
301 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0322  protein of unknown function DUF199  24.3 
 
 
325 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2287  protein of unknown function DUF199  23.91 
 
 
313 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.597794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1049  hypothetical protein  28.8 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0332  hypothetical protein  26.81 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1619  protein of unknown function DUF199  31.11 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0533  hypothetical protein  24.43 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0569  hypothetical protein  28.88 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0395  hypothetical protein  28.12 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0418  protein of unknown function DUF199  28.98 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1157  hypothetical protein  23.9 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0877  hypothetical protein  23.79 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1375  hypothetical protein  29.32 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.771097  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0925  protein of unknown function DUF199  28.88 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.450836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0260  hypothetical protein  27.96 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1004  hypothetical protein  24.18 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000778063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1126  hypothetical protein  24.18 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000275949  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0781  hypothetical protein  20.63 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0887  protein of unknown function DUF199  30 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0079  hypothetical protein  26.62 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2006  hypothetical protein  35.75 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2027  protein of unknown function DUF199  20.89 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.311282  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf687  hypothetical protein  26.61 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>