35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4805 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  749    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  25.43 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  27.71 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  27.71 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  28.01 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  27.71 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  27.71 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  27.71 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  28 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  28.8 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  24 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  27.57 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6791  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  27.57 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  22.19 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3009  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2069  major facilitator transporter  25 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3186  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  29.09 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>