33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0617 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  60.98 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  60.98 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  45.1 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  45.1 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 406 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  44.59 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  45.36 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  47.32 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  24.92 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  27.59 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  24.27 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.4 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0167  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3009  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0705  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0183835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>