13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0935 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  100 
 
 		 479 aa  920    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4352  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  27.71 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  25.58 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>