8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4352 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4352  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4620  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.518996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  25.07 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>