11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5491 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  100 
 
 		 372 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1937  major facilitator superfamily permease  50.96 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7679  Permeases of the major facilitator superfamily  38.79 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  24.72 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4352  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  24.06 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>