12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0167 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 400 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1937  major facilitator superfamily permease  49.21 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  43.82 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7679  Permeases of the major facilitator superfamily  36.94 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  25.26 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4193  hypothetical protein  30.6 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4352  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>