37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2604 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  788    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  30 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  30 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0705  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0183835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  32.67 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  29.41 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  32.67 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  29.64 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  29.36 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  29.36 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  29.36 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  27.9 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  31.91 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  26.75 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3506  hypothetical protein  39.18 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2678  putative MFS transporter  26.24 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0167  hypothetical protein  23.82 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3009  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>