16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3212 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  26.01 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  24.69 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1342  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  0.0153887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  25 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  24.48 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 402 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  23.63 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  23.63 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>