23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0164 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0167  hypothetical protein  40.05 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  27.25 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  26.25 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  26.25 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4352  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  25.29 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  30.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  30.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  30.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  30.66 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  30.66 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  30.66 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>