13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0382 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  768    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3212  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  24.58 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  25.23 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1937  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7679  Permeases of the major facilitator superfamily  25.21 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1206  hypothetical protein  29.38 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.572121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>