16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2394 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  738    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1937  major facilitator superfamily permease  67.55 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  59.57 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5491  permease (MFS superfamily)  48.78 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0324722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7679  Permeases of the major facilitator superfamily  43.01 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0382  hypothetical protein  24.79 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4193  hypothetical protein  25.25 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>