19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2783 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2783  major facilitator transporter  100 
 
 
396 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  28.93 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  26.51 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0935  major facilitator transporter  25.9 
 
 
479 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  27.73 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  27.73 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  26.07 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4805  hypothetical protein  30.37 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279377  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  27.73 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
397 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  27.54 
 
 
397 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  26.24 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  25.43 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  23.74 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  26.07 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  26.07 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  26.07 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  23.69 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>