23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3800 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3589  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.717364  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0617  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1027  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5227  MFS permease  23.6 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0705  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0183835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1343  hypothetical protein  24.66 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5231  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6149  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1930  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3009  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1918  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3186  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2490  transpoter  26.62 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2374  major facilitator family transporter  26.62 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.774703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15270  hypothetical protein  24.32 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0539595  hitchhiker  0.000000000000190229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1953  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0354333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2112  hypothetical protein  28.45 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2333  major facilitator superfamily permease  27.83 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3338  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1967  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1474  hypothetical protein  27.83 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>