43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3572 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  56.58 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  38.33 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  35.89 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.93 
 
 		 309 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  31.43 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  37.01 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  32.54 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  32.61 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  36.65 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.25 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  34.04 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  30.41 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  26.11 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  39.47 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  42.68 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  28.5 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.86 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.02 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  27.23 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  37.68 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  33.94 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.3 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  43.1 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.98 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.1 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  41.38 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  43.86 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  36.84 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.28 
 
 		 149 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1910  hypothetical protein  28 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  37.14 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  31.03 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  40.82 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3381  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.94 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  37.14 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  40.54 
 
 		 361 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.83 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  46.15 
 
 		 148 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  33.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  43.1 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  42.86 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>