25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1211 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.1 
 
 		 309 aa  252  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  40.75 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  37.95 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  39.51 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  39.55 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  34.21 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  33.93 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  37.41 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  43 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.77 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  32.97 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.58 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  30.54 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  48.21 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.38 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  26.92 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  38.89 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  26.61 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  30 
 
 		 428 aa  45.8  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  33.85 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  24.02 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  26.32 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  34.85 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>