23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01318 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  43 
 
 		 303 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  39.8 
 
 		 301 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  40.72 
 
 		 303 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.8 
 
 		 309 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  39.11 
 
 		 305 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.82 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  36.73 
 
 		 304 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  32 
 
 		 307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  32.84 
 
 		 285 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  33.5 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.41 
 
 		 288 aa  92  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  28.99 
 
 		 330 aa  91.3  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  25.13 
 
 		 404 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  33.78 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  23.78 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.24 
 
 		 330 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  31.58 
 
 		 428 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.26 
 
 		 300 aa  44.7  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  22.68 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  33.96 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  21.5 
 
 		 270 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>