21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3012 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  100 
 
 		 398 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  34.44 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  29.74 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  29.23 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.17 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  27.78 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  24.87 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  25 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  25.27 
 
 		 307 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  26.02 
 
 		 303 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  32.81 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0239  tubulin-tyrosine ligase  35.29 
 
 		 829 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  24.86 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  28.28 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  28.41 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  40.32 
 
 		 154 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  22.68 
 
 		 203 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  27.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1985  HPr kinase  29.03 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2699  HPr kinase  28.21 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>